La posguerra comienza con un gran éxito para el club, alzándose con su segunda Copa de España en 1940, denominada por aquel entonces Copa del Generalísimo al imponerse en la final al Madrid Club de Fútbol por dos goles a uno. También se jugó en 1940 la que es el precedente de la Supercopa de España de Fútbol, equipacion liverpool 2024 denominada Copa de Campeones de España que se perdió ante el Atlético Aviación por un global de 10 goles a 4 favorable a los madrileños.
