9 de julio de 2006, se volvió a enfrentar contra todo pronóstico a suizo Federer en la final del torneo londinense de Wimbledon, aunque en esta ocasión la victoria fue para el número uno del mundo por 0-6, 6-7, 7-6 y 3-6. De esta manera, equipacoin de brasil Federer conquistó su cuarto título en el All England Club consecutivo. Apenas un mes más tarde y tras caer en cuartos de final de Queens Club ante Lleyton Hewitt, en Wimbledon llegó la sorpresa.